Paket: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5 und andere)

[ Quellcode: tvc  ]

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

Andere Pakete mit Bezug zu tvc

• dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.1+dfsg) [ia64]

  streamlined C++ linear algebra library

• dep: libarmadillo14 (>= 1:14.0.1+dfsg) [nicht arm64, ia64]

  streamlined C++ linear algebra library

  dep: libarmadillo14 (>= 1:14.2.3+dfsg) [arm64]

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libblas3 [sparc64]

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  library for entropy measurement of byte streams

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, s390x, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5) [ia64]

  C++-Bibliothek zum Lesen und Schreiben von JavaScript Object Notation

• dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6) [nicht ia64]

  C++-Bibliothek zum Lesen und Schreiben von JavaScript Object Notation

• dep: liblapack3 [sparc64]

  Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

  oder liblapack.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht alpha]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1.037,8 kB	3.734,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1.088,5 kB	3.505,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b4	993,8 kB	3.349,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	963,5 kB	3.177,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	977,4 kB	2.697,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1.016,8 kB	3.219,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1.117,9 kB	3.544,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1.176,5 kB	5.139,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b2	1.021,5 kB	3.333,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	952,2 kB	3.208,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1.003,8 kB	3.751,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1.056,5 kB	3.870,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1.067,7 kB	3.732,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1.048,0 kB	2.913,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1.061,0 kB	3.520,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1.061,5 kB	3.088,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	959,0 kB	5.541,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1.077,6 kB	3.379,0 kB	[Liste der Dateien]