Пакет: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5 и други)

[ Източник: tvc  ]

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

Други пакети, свързани с tvc

• dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.1+dfsg) [ia64]

  streamlined C++ linear algebra library

• dep: libarmadillo14 (>= 1:14.0.1+dfsg) [не ia64]

  streamlined C++ linear algebra library

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libblas3 [sparc64]

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  или libblas.so.3

  виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  library for entropy measurement of byte streams

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5) [ia64]

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6) [не ia64]

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: liblapack3 [sparc64]

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  или liblapack.so.3

  виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не alpha]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

Изтегляне на tvc

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1 037,8 кБ	3 734,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1 088,5 кБ	3 505,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	992,7 кБ	3 349,0 кБ	[списък на файловете]
armel	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	963,5 кБ	3 177,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	977,4 кБ	2 697,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1 016,8 кБ	3 219,0 кБ	[списък на файловете]
i386	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1 117,9 кБ	3 544,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1 176,5 кБ	5 139,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	952,2 кБ	3 208,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1 003,8 кБ	3 751,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1 056,5 кБ	3 870,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1 067,7 кБ	3 732,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1 048,0 кБ	2 913,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1 061,0 кБ	3 520,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1 061,5 кБ	3 088,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	959,0 кБ	5 541,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1 077,6 кБ	3 379,0 кБ	[списък на файловете]