Package: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5 and others)

[ Source: tvc  ]

strumento per identificare varianti per le piattaforme di sequenziamento Ion Torrent

Torrent Variant Caller (TVC) è uno strumento per identificare varianti per le piattaforme di sequenziamento Ion Torrent ed è specialmente ottimizzato per sfruttare le informazioni del flusso di segnali sottostante nel modello statistico per valutare le varianti. Torrent Variant Caller è progettato per identificare polimorfismi a singolo nucleotide (SNP), polimorfismi a nucleotide multiplo (MNP), inserzioni, delezioni e sostituzioni di blocchi.

Other Packages Related to tvc

• dep: libarmadillo12 (>= 1:12.6.1+dfsg) [ia64]

  libreria snella in C++ per algebra lineare

• dep: libarmadillo14 (>= 1:14.0.1+dfsg) [not ia64]

  libreria snella in C++ per algebra lineare

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  libreria dinamica per manipolare file BAM (allineamento di genoma)

• dep: libblas3 [sparc64]

  implementazione di riferimento dell'algebra lineare di base, libreria condivisa

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  libreria per la misura dell'entropia di flussi di byte

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, s390x, x32]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5) [ia64]

  libreria per leggere e scrivere JSON per C++

• dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6) [not ia64]

  libreria per leggere e scrivere JSON per C++

• dep: liblapack3 [sparc64]

  libreria di routine per l'algebra lineare 3 - versione condivisa

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determina regioni simili tra due stringhe o sequenze genomiche (libreria)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not alpha]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-2) [alpha]

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,037.8 kB	3,734.0 kB	[list of files]
amd64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,088.5 kB	3,505.0 kB	[list of files]
arm64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	992.7 kB	3,349.0 kB	[list of files]
armel	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	963.5 kB	3,177.0 kB	[list of files]
armhf	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	977.4 kB	2,697.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,016.8 kB	3,219.0 kB	[list of files]
i386	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,117.9 kB	3,544.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1	1,176.5 kB	5,139.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	952.2 kB	3,208.0 kB	[list of files]
mips64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,003.8 kB	3,751.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,056.5 kB	3,870.0 kB	[list of files]
ppc64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,067.7 kB	3,732.0 kB	[list of files]
riscv64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,048.0 kB	2,913.0 kB	[list of files]
s390x	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,061.0 kB	3,520.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,061.5 kB	3,088.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	959.0 kB	5,541.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,077.6 kB	3,379.0 kB	[list of files]