Pacote: sprai (0.9.9.23+dfsg1-3)

[ Fonte: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Outros pacotes relacionados a sprai

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall

• dep: time

  programa "time" do GNU para medição do uso de recursos da CPU

• sug: make

  utilitário para compilação direta

• sug: pbalign

  Pacote não disponível

• sug: pbgenomicconsensus

  Pacote não disponível

• sug: pbh5tools

  Pacote não disponível

Download de sprai

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	1,477.2 kB	1,713.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1,473.8 kB	1,881.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1,473.0 kB	1,693.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1,471.6 kB	1,669.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1,477.6 kB	1,713.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1,477.2 kB	1,885.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1,478.1 kB	1,881.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1,474.3 kB	1,689.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1,476.0 kB	1,701.0 kB	[lista de arquivos]