Pacote: phybin (0.3-6 e outros)

[ Fonte: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Outros pacotes relacionados a phybin

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k]

  biblioteca de apoio que provê funções embutidas __atomic

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, x32]

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libffi8 (>= 3.4)

  Biblioteca runtime Interface de Função Estrangeira

• dep: libgmp10 (>= 2:6.2.1+dfsg1) [não alpha, loong64, riscv64, x32]

  biblioteca aritmética de multi precisão

  dep: libgmp10 (>= 2:6.3.0+dfsg) [alpha, loong64, riscv64]

• dep: libnuma1 (>= 2.0.11) [alpha]

  bibliotecas para controlar políticas NUMA

Download de phybin

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	0.3-6	6,346.1 kB	62,611.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	0.3-6	1,614.5 kB	11,976.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.3-6	4,125.4 kB	30,322.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.3-6	4,407.2 kB	28,552.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.3-6	4,444.7 kB	28,524.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	0.3-6	4,884.4 kB	57,349.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.3-6	4,957.4 kB	37,630.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	0.3-6	6,913.7 kB	182,517.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	0.3-6	5,992.4 kB	58,021.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	0.3-6	3,207.8 kB	33,307.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.3-6	5,284.0 kB	58,772.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	0.3-6	3,407.6 kB	45,840.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.3-6	3,498.6 kB	38,137.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	0.3-6+b1	4,531.3 kB	31,537.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.3-6	7,543.2 kB	53,627.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	0.3-6	4,193.3 kB	74,794.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	0.3-5+b1	9,291.3 kB	38,282.0 kB	[lista de arquivos]