パッケージ: phybin (0.3-6 など)

[ ソース: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

その他の phybin 関連パッケージ

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k]

  __atomic ビルトイン関数を提供するサポートライブラリ

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [ia64, x32 以外]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

• dep: libffi8 (>= 3.4)

  Foreign Function Interface ランタイムライブラリ

• dep: libgmp10 (>= 2:6.2.1+dfsg1) [riscv64, x32 以外]

  多倍長精度演算ライブラリ

  dep: libgmp10 (>= 2:6.3.0+dfsg) [riscv64]

phybin のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	0.3-6	1,614.5 kB	11,976.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.3-6	4,125.4 kB	30,322.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.3-6	4,407.2 kB	28,552.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.3-6	4,444.7 kB	28,524.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	0.3-6	4,884.4 kB	57,349.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.3-6	4,957.4 kB	37,630.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	0.3-6	6,913.7 kB	182,517.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	0.3-6	3,207.8 kB	33,307.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.3-6	5,284.0 kB	58,772.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.3-6	3,407.6 kB	45,840.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.3-6	3,498.6 kB	38,137.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.3-6+b1	4,531.3 kB	31,537.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.3-6	7,543.2 kB	53,627.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0.3-6	4,193.3 kB	74,794.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.3-5+b1	9,291.3 kB	38,282.0 kB	[ファイル一覧]