Pacote: phybin (0.3-6)

[ Fonte: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Outros pacotes relacionados a phybin

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, mipsel]

  biblioteca de apoio que provê funções embutidas __atomic

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libffi8 (>= 3.4)

  Biblioteca runtime Interface de Função Estrangeira

• dep: libgmp10 (>= 2:6.2.1+dfsg1)

  biblioteca aritmética de multi precisão

Download de phybin

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	1,614.5 kB	11,976.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	4,125.4 kB	30,322.0 kB	[lista de arquivos]
armel	4,407.2 kB	28,552.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	4,444.7 kB	28,524.0 kB	[lista de arquivos]
i386	4,957.4 kB	37,630.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	5,284.0 kB	58,772.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	3,528.3 kB	40,639.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	3,498.6 kB	38,137.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	7,543.2 kB	53,627.0 kB	[lista de arquivos]