Пакет: phybin (0.3-6 и другие)

[ Источник: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Другие пакеты, относящиеся к phybin

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k]

  библиотека для атомарного выполнения кода

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [не ia64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

• dep: libffi8 (>= 3.4)

  библиотека для связывания программ написанных на разных языках

• dep: libgmp10 (>= 2:6.2.1+dfsg1) [не riscv64, x32]

  библиотека для работы с числами произвольной точности

  dep: libgmp10 (>= 2:6.3.0+dfsg) [riscv64]

Загрузка phybin

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	0.3-6	1 614,5 Кб	11 976,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.3-6	4 125,4 Кб	30 322,0 Кб	[список файлов]
armel	0.3-6	4 407,2 Кб	28 552,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.3-6	4 444,7 Кб	28 524,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.3-6	4 884,4 Кб	57 349,0 Кб	[список файлов]
i386	0.3-6	4 957,4 Кб	37 630,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.3-6	6 913,7 Кб	182 517,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.3-6	3 207,8 Кб	33 307,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.3-6	5 284,0 Кб	58 772,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.3-6	3 407,6 Кб	45 840,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.3-6	3 498,6 Кб	38 137,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.3-6+b1	4 531,3 Кб	31 537,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.3-6	7 543,2 Кб	53 627,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.3-6	4 193,3 Кб	74 794,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.3-5+b1	9 291,3 Кб	38 282,0 Кб	[список файлов]