Paket: phybin (0.3-6 och andra)

[ Källkod: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Andra paket besläktade med phybin

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k]

  support library providing __atomic built-in functions

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [ej ia64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

• dep: libffi8 (>= 3.4)

  Foreign Function Interface library runtime

• dep: libgmp10 (>= 2:6.2.1+dfsg1) [ej riscv64, x32]

  Multiprecision arithmetic library

  dep: libgmp10 (>= 2:6.3.0+dfsg) [riscv64]

Hämta phybin

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	0.3-6	1.614,5 kbyte	11.976,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.3-6	4.125,4 kbyte	30.322,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.3-6	4.407,2 kbyte	28.552,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.3-6	4.444,7 kbyte	28.524,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	0.3-6	4.884,4 kbyte	57.349,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.3-6	4.957,4 kbyte	37.630,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	0.3-6	6.913,7 kbyte	182.517,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	0.3-6	3.207,8 kbyte	33.307,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.3-6	5.284,0 kbyte	58.772,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	0.3-6	3.407,6 kbyte	45.840,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.3-6	3.498,6 kbyte	38.137,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.3-6+b1	4.531,3 kbyte	31.537,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.3-6	7.543,2 kbyte	53.627,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	0.3-6	4.193,3 kbyte	74.794,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.3-5+b1	9.291,3 kbyte	38.282,0 kbyte	[filförteckning]