Pacote: phybin (0.3-3)

[ Fonte: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Outros pacotes relacionados a phybin

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  biblioteca de apoio que provê funções embutidas __atomic

• dep: libc6 (>= 2.27) [amd64, arm64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.28) [armhf, i386]

• dep: libffi6 (>= 3.0.4) [não arm64]

  Biblioteca runtime Interface de Função Estrangeira

  dep: libffi6 (>= 3.2) [arm64]

• dep: libgmp10

  biblioteca aritmética de multi precisão

Download de phybin

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	1,534.7 kB	11,701.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1,939.1 kB	14,511.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1,779.1 kB	11,932.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1,562.5 kB	9,141.0 kB	[lista de arquivos]