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Paket: phybin (0.3-6 und andere)

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Ähnliche Pakete:

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

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armel 0.3-6 4.407,2 kB28.552,0 kB [Liste der Dateien]
armhf 0.3-6 4.444,7 kB28.524,0 kB [Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung) 0.3-6 4.884,4 kB57.349,0 kB [Liste der Dateien]
i386 0.3-6 4.957,4 kB37.630,0 kB [Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung) 0.3-6 6.913,7 kB182.517,0 kB [Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung) 0.3-6 3.207,8 kB33.307,0 kB [Liste der Dateien]
mips64el 0.3-6 5.284,0 kB58.772,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung) 0.3-6 3.407,6 kB45.840,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 0.3-6 3.498,6 kB38.137,0 kB [Liste der Dateien]
riscv64 0.3-6+b1 4.531,3 kB31.537,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 0.3-6 7.543,2 kB53.627,0 kB [Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung) 0.3-6 4.193,3 kB74.794,0 kB [Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung) 0.3-5+b1 9.291,3 kB38.282,0 kB [Liste der Dateien]