Pacote: daligner (1.0+git20200727.ed40ce5-3)

[ Fonte: daligner  ]

descoberta de alinhamento local entre longas leituras de sequenciamento de nucleotídeos

Estas ferramentas permitem que se encontre todos os alinhamentos locais significativos entre leituras codificadas numa base de dados Dazzler. A premissa é que as leituras vêm de um sequenciador de leituras longas Pacific Biosciences RS II. Isto é, as leituras são longas e cheias de ruído, em média até 15%.

Etiquetas: Implementado em: C, Interface de usuário(a): Linha de comando, Função: Programa

Outros pacotes relacionados a daligner

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

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Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	200.3 kB	1,508.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	173.8 kB	1,408.0 kB	[lista de arquivos]
armel	168.3 kB	1,436.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	170.4 kB	1,024.0 kB	[lista de arquivos]
i386	192.0 kB	1,696.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	167.0 kB	1,575.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	174.3 kB	1,632.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	198.3 kB	2,188.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	188.9 kB	1,572.0 kB	[lista de arquivos]