Pakiet: tantan (51-1)

[ Pakiet źródłowy: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: scope::utility, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z tantan

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, riscv64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armel, armhf]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

Pobieranie tantan

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	41,3 KiB	120,0 KiB	[lista plików]
arm64	37,7 KiB	144,0 KiB	[lista plików]
armel	36,9 KiB	107,0 KiB	[lista plików]
armhf	34,9 KiB	79,0 KiB	[lista plików]
i386	44,5 KiB	119,0 KiB	[lista plików]
mips64el	41,2 KiB	149,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	43,9 KiB	144,0 KiB	[lista plików]
riscv64	40,1 KiB	92,0 KiB	[lista plików]
s390x	44,5 KiB	124,0 KiB	[lista plików]