Pakiet: snpomatic (1.0-5)

[ Pakiet źródłowy: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie snpomatic

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	81,0 KiB	209,0 KiB	[lista plików]
arm64	73,5 KiB	189,0 KiB	[lista plików]
armel	66,2 KiB	172,0 KiB	[lista plików]
armhf	68,4 KiB	128,0 KiB	[lista plików]
i386	82,4 KiB	212,0 KiB	[lista plików]
mips64el	75,9 KiB	227,0 KiB	[lista plików]
mipsel	75,7 KiB	216,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	82,4 KiB	281,0 KiB	[lista plików]
s390x	72,5 KiB	205,0 KiB	[lista plików]