Pakiet: python-biopython (1.70+dfsg-2 i inne) [debports]

[ Pakiet źródłowy:  ]

Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)

The Biopython Project is an international association of developers of freely available Python tools for computational molecular biology.

It is a distributed collaborative effort to develop Python libraries and applications which address the needs of current and future work in bioinformatics. The source code is made available under the Biopython License, which is extremely liberal and compatible with almost every license in the world. The project works along with the Open Bioinformatics Foundation, who generously provide web and CVS space for the project.

This package is targeting Python version 2.

Inne pakiety związane z python-biopython

• dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [sparc64]

• dep: python [sparc64]

  Pakiet niedostępny

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7)

• dep: python-numpy (>= 1:1.10.0~b1) [sparc64]

  Pakiet niedostępny

  dep: python-numpy (>= 1:1.8.0) [hppa]

• dep: python-numpy-abi9

  Pakiet niedostępny

• dep: python-reportlab

  Pakiet niedostępny

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• rec: python-biopython-doc (= 1.65+dfsg-1) [hppa]

  Documentation for the Biopython library

  rec: python-biopython-doc (= 1.70+dfsg-2) [sparc64]

• sug: clustalo

  General-purpose multiple sequence alignment program for proteins

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: dialign

  Dopasowanie wielu sekwencji w oparciu o segmenty

• sug: dssp

  Ustalanie drugorzędowej struktury białek na podstawie struktury 3D

• sug: emboss

  European molecular biology open software suite

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• sug: muscle

  Multiple alignment program of protein sequences

• sug: phylip [sparc64]

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: phyml

  Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

• sug: python-matplotlib

  Pakiet niedostępny

• sug: python-mysqldb

  Pakiet niedostępny

• sug: python-pil

  Pakiet niedostępny

• sug: python-psycopg2

  Pakiet niedostępny

• sug: python-rdflib (>= 4)

  Pakiet niedostępny

• sug: python-renderpm

  Pakiet niedostępny

• sug: python-scipy [sparc64]

  Pakiet niedostępny

• sug: python-tk

  Pakiet niedostępny

• sug: raxml

  Randomizowane maksymalne prawdopodobieństwo drzew filogenetycznych

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

• sug: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

• sug: wise (>= 2.4.1-16)

  comparison of biopolymers, like DNA and protein sequences

Pobieranie python-biopython

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
hppa (port nieoficjalny)	1.65+dfsg-1	1 151,5 KiB	7 815,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.70+dfsg-2	1 137,3 KiB	8 036,0 KiB	[lista plików]