Pakiet: kleborate (2.4.1-5 i inne)

[ Pakiet źródłowy: kleborate  ]

tool to screen Klebsiella genome assemblies

Kleborate is a tool to screen Klebsiella genome assemblies for:

 * MLST sequence type
 * species (e.g. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.)
 * ICEKp associated virulence loci: yersiniabactin (ybt),
   colibactin (clb)
 * virulence plasmid associated loci: salmochelin (iro), aerobactin
   (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2)
 * antimicrobial resistance genes, including quinolone resistance SNPs
   and colistin resistance truncations
 * K (capsule) and O antigen (LPS) serotype prediction, via wzi alleles
   and Kaptive

Inne pakiety związane z kleborate

• dep: kaptive

  obtain information about K and O types for Klebsiella genome assemblies

• dep: kaptive-data

  reference data for kaptive for Klebsiella genome assemblies

• dep: mash

  fast genome and metagenome distance estimation using MinHash

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-distutils [m68k]

  Pakiet niedostępny

• dep: python3-pkg-resources [nie alpha, m68k, ppc64]

  Wykrywanie pakietów i udostępnianie zasobów przy użyciu pkg_resources

Pobieranie kleborate

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.4.1-3	7 558,8 KiB	62 170,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.4.1-5	7 559,6 KiB	62 170,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.4.1-5	7 559,6 KiB	62 170,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	2.4.1-5	7 559,6 KiB	62 170,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.1.0-2	7 518,1 KiB	61 504,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.4.1-5	7 559,6 KiB	62 170,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.4.1-3	7 555,3 KiB	62 001,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.4.1-5	7 559,6 KiB	62 170,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.4.1-5	7 559,6 KiB	62 170,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.4.1-5	7 558,5 KiB	62 001,0 KiB	[lista plików]