套件：kleborate（2.4.1-4 以及其他的）

[ 原始碼： kleborate  ]

tool to screen Klebsiella genome assemblies

Kleborate is a tool to screen Klebsiella genome assemblies for:

 * MLST sequence type
 * species (e.g. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.)
 * ICEKp associated virulence loci: yersiniabactin (ybt),
   colibactin (clb)
 * virulence plasmid associated loci: salmochelin (iro), aerobactin
   (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2)
 * antimicrobial resistance genes, including quinolone resistance SNPs
   and colistin resistance truncations
 * K (capsule) and O antigen (LPS) serotype prediction, via wzi alleles
   and Kaptive

其他與 kleborate 有關的套件

• dep: kaptive

  obtain information about K and O types for Klebsiella genome assemblies

• dep: kaptive-data

  reference data for kaptive for Klebsiella genome assemblies

• dep: mash

  fast genome and metagenome distance estimation using MinHash

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-distutils [m68k]

  套件暫時不可用

• dep: python3-pkg-resources [除 alpha, m68k, ppc64]

  Package Discovery and Resource Access using pkg_resources

下載 kleborate

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	2.4.1-3	7，558。8 kB	62，170。0 kB	[檔案列表]
amd64	2.4.1-4	7，561。0 kB	62，182。0 kB	[檔案列表]
arm64	2.4.1-4	7，557。7 kB	62，182。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	2.1.0-2	7，518。1 kB	61，504。0 kB	[檔案列表]
mips64el	2.4.1-4	7，562。7 kB	62，182。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	2.4.1-3	7，555。3 kB	62，001。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	2.4.1-4	7，562。4 kB	62，182。0 kB	[檔案列表]
riscv64	2.4.1-4	7，561。0 kB	62，182。0 kB	[檔案列表]
s390x	2.4.1-4	7，552。9 kB	62，013。0 kB	[檔案列表]