Pakiet: bcftools (1.21-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: bcftools  ]

Wywoływanie wariantów genomowych oraz zarządzanie plikami VCF i BCF

BCFtools to zestaw narzędzi, które manipulują wywołaniami wariantowymi w formacie Variant Call Format (VCF) i jego binarnym odpowiedniku BCF. Wszystkie polecenia działają w sposób przejrzysty zarówno z plikami VCF, jak i BCF, zarówno nieskompresowanymi, jak i skompresowanymi przy użyciu BGZF.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Rola: Program

Inne pakiety związane z bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3-gffutils [ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• dep: python3-matplotlib [ia64]

  System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

• dep: sse2-support [i386]

  CPU feature checking - require SSE2

• rec: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• rec: python3-gffutils [nie ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• rec: python3-matplotlib [nie ia64]

  System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

• sug: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• sug: python3-numpy

  Biblioteka Pythona do obliczeń numerycznych (Python 3)

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

Pobieranie bcftools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.21-1	742,7 KiB	4 293,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.21-1	765,3 KiB	2 716,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.21-1	689,7 KiB	4 156,0 KiB	[lista plików]
armel	1.21-1	671,3 KiB	4 044,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.21-1	673,1 KiB	3 724,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.21-1	771,1 KiB	2 526,0 KiB	[lista plików]
i386	1.21-1	809,6 KiB	2 812,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.20-1	909,4 KiB	4 403,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1.21-1	728,8 KiB	4 205,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.21-1	672,7 KiB	2 364,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.21-1	702,5 KiB	4 357,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.21-1	782,1 KiB	4 599,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.21-1	799,1 KiB	4 596,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.21-1	753,1 KiB	2 210,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.21-1	785,2 KiB	2 765,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.21-1	814,5 KiB	3 919,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.21-1	741,3 KiB	42 424,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.21-1	758,9 KiB	2 520,0 KiB	[lista plików]