Pakiet: bcftools (1.9-1)

[ Pakiet źródłowy: bcftools  ]

Wywoływanie wariantów genomowych oraz zarządzanie plikami VCF i BCF

BCFtools to zestaw narzędzi, które manipulują wywołaniami wariantowymi w formacie Variant Call Format (VCF) i jego binarnym odpowiedniku BCF. Wszystkie polecenia działają w sposób przejrzysty zarówno z plikami VCF, jak i BCF, zarówno nieskompresowanymi, jak i skompresowanymi przy użyciu BGZF.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Rola: Program

Inne pakiety związane z bcftools

• dep: libc6 (>= 2.23)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libhts2 (>= 1.6)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• sug: python

  Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)

• sug: python-matplotlib

  System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

• sug: python-numpy

  Szybkie dodawanie obiektów tablicy, moduł do języka Python

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

Pobieranie bcftools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	514,3 KiB	1 846,0 KiB	[lista plików]
arm64	466,6 KiB	1 639,0 KiB	[lista plików]
armhf	454,7 KiB	1 263,0 KiB	[lista plików]