Paquet : bcftools (1.21-1 et autres)

[ Paquet source : bcftools  ]

appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF

BCFtools est un ensemble d'outils qui manipulent des appels de variation dans le format « Variant Call Format » (VCF) et son équivalent binaire BCF. Toutes les commandes fonctionnent de façon transparente avec VCF et BCF, qu'ils soient compressés avec BGZF ou non.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Rôle: Programme

Autres paquets associés à bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3-gffutils [ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• dep: python3-matplotlib [ia64]

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab

• dep: sse2-support [i386]

  CPU feature checking - require SSE2

• rec: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• rec: python3-gffutils [non ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• rec: python3-matplotlib [non ia64]

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab

• sug: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• sug: python3-numpy

  bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live : paquets recommandés pour LaTeX

Télécharger bcftools

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.21-1	742,7 ko	4 293,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.21-1	765,3 ko	2 716,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.21-1	689,7 ko	4 156,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.21-1	671,3 ko	4 044,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.21-1	673,1 ko	3 724,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.21-1	771,1 ko	2 526,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.21-1	809,6 ko	2 812,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.20-1	909,4 ko	4 403,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.21-1	728,8 ko	4 205,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.21-1	672,7 ko	2 364,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.21-1	702,5 ko	4 357,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.21-1	782,1 ko	4 599,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.21-1	799,1 ko	4 596,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.21-1	753,1 ko	2 210,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.21-1	785,2 ko	2 765,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.21-1	814,5 ko	3 919,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.21-1	741,3 ko	42 424,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.21-1	758,9 ko	2 520,0 ko	[liste des fichiers]