Paquet : bcftools (1.20-2 et autres)

[ Paquet source : bcftools  ]

appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF

BCFtools est un ensemble d'outils qui manipulent des appels de variation dans le format « Variant Call Format » (VCF) et son équivalent binaire BCF. Toutes les commandes fonctionnent de façon transparente avec VCF et BCF, qu'ils soient compressés avec BGZF ou non.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Rôle: Programme

Autres paquets associés à bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3-gffutils [ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• dep: python3-matplotlib [ia64]

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab

• dep: sse2-support [i386]

  CPU feature checking - require SSE2

• rec: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• rec: python3-gffutils [non ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• rec: python3-matplotlib [non ia64]

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab

• sug: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• sug: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live : paquets recommandés pour LaTeX

Télécharger bcftools

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.20-2	724,5 ko	4 292,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.20-2	742,1 ko	2 632,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.20-2	668,6 ko	4 035,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.20-2	656,6 ko	2 359,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.20-2	654,9 ko	1 824,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.20-2	758,8 ko	2 509,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.20-2	784,4 ko	2 728,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.20-1	909,4 ko	4 403,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.20-2	644,0 ko	2 246,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.20-2	676,8 ko	4 355,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.20-2	761,4 ko	4 583,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.20-2	777,8 ko	4 610,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.20-2	735,9 ko	2 184,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.20-2	766,6 ko	2 739,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.20-2	797,8 ko	3 854,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.20-2	726,0 ko	42 439,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.20-2	735,6 ko	2 434,0 ko	[liste des fichiers]