Paketti: bcftools (1.20-2 ja muut)

[ Source: bcftools  ]

genomic variant calling and manipulation of VCF/BCF files

BCFtools is a set of utilities that manipulate variant calls in the Variant Call Format (VCF) and its binary counterpart BCF. All commands work transparently with both VCFs and BCFs, both uncompressed and BGZF-compressed.

Tagit: Implemented in: C, Role: Program

Muut pakettiin bcftools liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3-gffutils [ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• dep: python3-matplotlib [ia64]

  Python based plotting system in a style similar to Matlab

• dep: sse2-support [i386]

  CPU feature checking - require SSE2

• rec: perl

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

• rec: python3-gffutils [ei ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• rec: python3-matplotlib [ei ia64]

  Python based plotting system in a style similar to Matlab

• sug: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

Imuroi bcftools

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.20-2	724.5 kt	4,292.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.20-2	742.1 kt	2,632.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.20-2+b1	677.4 kt	4,101.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.20-2	656.6 kt	2,359.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.20-2	654.9 kt	1,824.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.20-2	758.8 kt	2,509.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.20-2	784.4 kt	2,728.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.20-1	909.4 kt	4,403.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.20-2	644.0 kt	2,246.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.20-2	676.8 kt	4,355.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.20-2	761.4 kt	4,583.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.20-2	777.8 kt	4,610.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.20-2	735.9 kt	2,184.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.20-2	766.6 kt	2,739.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.20-2	797.8 kt	3,854.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.20-2	726.0 kt	42,439.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.20-2	735.6 kt	2,434.0 kt	[tiedostoluettelo]