Balík: bcftools (1.20-2 a iné)

[ Zdroj: bcftools  ]

genomic variant calling and manipulation of VCF/BCF files

BCFtools is a set of utilities that manipulate variant calls in the Variant Call Format (VCF) and its binary counterpart BCF. All commands work transparently with both VCFs and BCFs, both uncompressed and BGZF-compressed.

Značky: Implementované v: C, Role: Program

Ostatné balíky súvisiace s balíkom bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3-gffutils [ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• dep: python3-matplotlib [ia64]

  systém v Pythone na vykresľovanie v štýle podobnom Matlabu

• dep: sse2-support [i386]

  CPU feature checking - require SSE2

• rec: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

• rec: python3-gffutils [nie ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• rec: python3-matplotlib [nie ia64]

  systém v Pythone na vykresľovanie v štýle podobnom Matlabu

• sug: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

Stiahnuť bcftools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.20-2	724.5 kB	4,292.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.20-2	742.1 kB	2,632.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.20-2+b1	677.4 kB	4,101.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.20-2	656.6 kB	2,359.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.20-2	654.9 kB	1,824.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.20-2	758.8 kB	2,509.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.20-2	784.4 kB	2,728.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.20-1	909.4 kB	4,403.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.20-2	644.0 kB	2,246.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.20-2	676.8 kB	4,355.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.20-2	761.4 kB	4,583.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.20-2	777.8 kB	4,610.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.20-2	735.9 kB	2,184.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.20-2	766.6 kB	2,739.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.20-2	797.8 kB	3,854.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.20-2	726.0 kB	42,439.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.20-2	735.6 kB	2,434.0 kB	[zoznam súborov]