Pakiet: bcftools (1.21-1)

[ Pakiet źródłowy: bcftools  ]

Wywoływanie wariantów genomowych oraz zarządzanie plikami VCF i BCF

BCFtools to zestaw narzędzi, które manipulują wywołaniami wariantowymi w formacie Variant Call Format (VCF) i jego binarnym odpowiedniku BCF. Wszystkie polecenia działają w sposób przejrzysty zarówno z plikami VCF, jak i BCF, zarówno nieskompresowanymi, jak i skompresowanymi przy użyciu BGZF.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Rola: Program

Inne pakiety związane z bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: sse2-support [i386]

  CPU feature checking - require SSE2

• rec: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• rec: python3-gffutils

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• rec: python3-matplotlib

  System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

• sug: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• sug: python3-numpy

  Biblioteka Pythona do obliczeń numerycznych (Python 3)

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

Pobieranie bcftools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	765,3 KiB	2 716,0 KiB	[lista plików]
arm64	689,7 KiB	4 156,0 KiB	[lista plików]
armel	671,3 KiB	4 044,0 KiB	[lista plików]
armhf	673,1 KiB	3 724,0 KiB	[lista plików]
i386	809,6 KiB	2 812,0 KiB	[lista plików]
mips64el	702,5 KiB	4 357,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	799,1 KiB	4 596,0 KiB	[lista plików]
riscv64	753,1 KiB	2 210,0 KiB	[lista plików]
s390x	785,2 KiB	2 765,0 KiB	[lista plików]