Paket: bcftools (1.21-1 und andere)

[ Quellcode: bcftools  ]

Aufruf und Manipulation genomischer Varianten von VCF/BCF-Dateien

BCFtools ist eine Reihe von Dienstprogrammen, die Variantenaufrufe im Variant Call Format (VCF) und dessen binärem Gegenstück BCF bearbeiten. Alle Befehle arbeiten transparent mit VCFs und BCFs, sowohl unkomprimiert als auch BGZF-komprimiert.

Markierungen: Implementiert in: C, Rolle: Programm

Andere Pakete mit Bezug zu bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: python3-gffutils [ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• dep: python3-matplotlib [ia64]

  Python-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen

• dep: sse2-support [i386]

  CPU feature checking - require SSE2

• rec: perl

  Larry Wall's Practical Extraction und Report Language

• rec: python3-gffutils [nicht ia64]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• rec: python3-matplotlib [nicht ia64]

  Python-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen

• sug: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

bcftools herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.21-1	742,7 kB	4.293,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.21-1	765,3 kB	2.716,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.21-1	689,7 kB	4.156,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.21-1	671,3 kB	4.044,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.21-1	673,1 kB	3.724,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.21-1	771,1 kB	2.526,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.21-1	809,6 kB	2.812,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.20-1	909,4 kB	4.403,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	1.21-1	728,8 kB	4.205,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.21-1	672,7 kB	2.364,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.21-1	702,5 kB	4.357,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.21-1	782,1 kB	4.599,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.21-1	799,1 kB	4.596,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.21-1	753,1 kB	2.210,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.21-1	785,2 kB	2.765,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.21-1	814,5 kB	3.919,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.21-1	741,3 kB	42.424,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.21-1	758,9 kB	2.520,0 kB	[Liste der Dateien]