[ Pakiet źródłowy: srst2 ]
Pakiet: srst2 (0.2.0-6)
Odnośniki dla srst2
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego srst2:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [katholt.github.io]
Podobne pakiety:
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Inne pakiety związane z srst2
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- Pakiet programów przeznaczonych do szybkiego grupowania sekwencji
-
- dep: python
- Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)
-
- dep: python-biopython
- Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)
-
- dep: python-scipy
- scientific tools for Python
-
- dep: samtools
- Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
-
- rec: python-rpy2
- Python 2 interface to the GNU R language and environment (version 2.8)
Pobieranie srst2
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| amd64 | 59,3 KiB | 259,0 KiB | [lista plików] |