[ Источник: srst2 ]
Пакет: srst2 (0.2.0-6)
Ссылки для srst2
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код srst2:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [katholt.github.io]
Подобные пакеты:
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Другие пакеты, относящиеся к srst2
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: python
- интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)
-
- dep: python-biopython
- Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)
-
- dep: python-scipy
- scientific tools for Python
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- rec: python-rpy2
- Python 2 interface to the GNU R language and environment (version 2.8)
Загрузка srst2
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 59,3 Кб | 259,0 Кб | [список файлов] |