[ Zdroj: srst2 ]
Balík: srst2 (0.2.0-6)
Odkazy pre srst2
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík srst2:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [katholt.github.io]
Podobné balíky:
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom srst2
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: python
- interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)
-
- dep: python-biopython
- knižnica na bioinformatiku implementovaná v jazyku Python 2
-
- dep: python-scipy
- vedecké nástroje pre Python
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- rec: python-rpy2
- Python 2 interface to the GNU R language and environment (version 2.8)
Stiahnuť srst2
| Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|
| amd64 | 59.3 kB | 259.0 kB | [zoznam súborov] |