Package: srst2 (0.2.0-6)

[ Source: srst2  ]

Kort læsesekvensindtastning for bakterielle patogener

Dette program er designet til at bruge Illumina-sekvensdata, en MLST-database og/eller en database med gensekvenser (f.eks. resistente gener, virulensgener etc.) og rapportere tilstedeværelsen af ST'er og/eller referencegener.

Other Packages Related to srst2

• dep: bowtie2

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• dep: cd-hit

  Programpakke designet til hurtigt at gruppere sekvenser

• dep: python

  Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

• dep: python-biopython

  Pythonbibliotek for bioinformatikere - implementeret i Python 2

• dep: python-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python

• dep: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• rec: python-rpy2

  Python 2 interface to the GNU R language and environment (version 2.8)

Download srst2

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	59.3 kB	259.0 kB	[list of files]