[ Source: srst2 ]
Пакунок: srst2 (0.2.0-6)
Links for srst2
Debian Resources:
Download Source Package srst2:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [katholt.github.io]
Similar packages:
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Інші пакунки пов'язані з srst2
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: python
- Інтерактивна об'єктно-орієнтована мова високого рівня (гілка 2.x)
-
- dep: python-biopython
- Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)
-
- dep: python-scipy
- scientific tools for Python
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- rec: python-rpy2
- Python 2 interface to the GNU R language and environment (version 2.8)
Завантажити srst2
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| amd64 | 59.3 kB | 259.0 kB | [список файлів] |