Pakiet: skewer (0.2.2-6 i inne)

[ Pakiet źródłowy: skewer  ]

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Inne pakiety związane z skewer

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie arm64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie skewer

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	0.2.2-6+b1	86,4 KiB	216,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.2.2-6+b2	79,1 KiB	236,0 KiB	[lista plików]
armel	0.2.2-6+b1	75,2 KiB	235,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.2.2-6+b1	75,5 KiB	171,0 KiB	[lista plików]
i386	0.2.2-6+b1	90,2 KiB	231,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.2.2-6+b1	81,5 KiB	242,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.2.2-6+b1	84,9 KiB	236,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.2.2-6+b1	80,3 KiB	159,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.2.2-6+b1	76,0 KiB	199,0 KiB	[lista plików]