Pakket: lagan (2.0-9)

[ Bron: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andere aan lagan gerelateerde pakketten

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
  Ook een virtueel pakket geboden door: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [niet armel, armhf]

  GCC support bibliotheek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ Library v3

lagan downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms

Platform	Pakketgrootte	Geïnstalleerde grootte	Bestanden
amd64	179,3 kB	835,0 kB	[overzicht]
arm64	170,3 kB	1.771,0 kB	[overzicht]
armel	163,8 kB	1.748,0 kB	[overzicht]
armhf	163,2 kB	1.748,0 kB	[overzicht]
i386	187,1 kB	836,0 kB	[overzicht]
mips64el	182,8 kB	1.865,0 kB	[overzicht]
mipsel	185,5 kB	1.844,0 kB	[overzicht]
ppc64el	200,1 kB	1.963,0 kB	[overzicht]
s390x	172,6 kB	795,0 kB	[overzicht]