[ ソース: covtobed ]
パッケージ: covtobed (1.3.5+dfsg-1 など)
convert the coverage track from a BAM file into a BED file
Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.
その他の covtobed 関連パッケージ
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- dep: bamtools
- BAM(ゲノムアラインメント)ファイルの操作用ツール
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- dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)
- dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: zlib1g
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
covtobed のダウンロード
アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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amd64 | 1.3.5+dfsg-1+b1 | 48.8 kB | 143.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 1.3.5+dfsg-1+b1 | 42.8 kB | 147.0 kB | [ファイル一覧] |
armel | 1.3.5+dfsg-1+b1 | 41.7 kB | 146.0 kB | [ファイル一覧] |
armhf | 1.3.5+dfsg-1+b1 | 43.1 kB | 146.0 kB | [ファイル一覧] |
i386 | 1.3.5+dfsg-1+b1 | 51.5 kB | 150.0 kB | [ファイル一覧] |
mips64el | 1.3.5+dfsg-1+b1 | 45.5 kB | 217.0 kB | [ファイル一覧] |
mipsel | 1.3.5+dfsg-1+b1 | 45.2 kB | 215.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 1.3.5+dfsg-1+b1 | 48.4 kB | 211.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 1.3.5+dfsg-1+b1 | 42.4 kB | 143.0 kB | [ファイル一覧] |