パッケージ: covtobed (1.3.5+dfsg-2 など)

[ ソース: covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

その他の covtobed 関連パッケージ

• dep: bamtools

  BAM（ゲノムアラインメント）ファイルの操作用ツール

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: zlib1g

  圧縮ライブラリ - ランタイム

covtobed のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.3.5+dfsg-2	45.8 kB	211.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.3.5+dfsg-2	49.8 kB	146.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.3.5+dfsg-2+b1	45.0 kB	147.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.3.5+dfsg-2	42.8 kB	125.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.3.5+dfsg-2	44.6 kB	97.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.3.5+dfsg-2	45.5 kB	123.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.3.5+dfsg-2	53.4 kB	149.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.3.5+dfsg-2	57.1 kB	240.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.3.5+dfsg-2	47.0 kB	137.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.3.5+dfsg-2	46.4 kB	215.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.3.5+dfsg-2	49.7 kB	210.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.3.5+dfsg-2	49.7 kB	210.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.3.5+dfsg-2+b1	48.2 kB	111.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.3.5+dfsg-2	46.3 kB	138.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.3.5+dfsg-2	54.0 kB	145.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.3.5+dfsg-2	39.5 kB	1,045.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.3.5+dfsg-2	50.4 kB	133.0 kB	[ファイル一覧]