Пакет: covtobed (1.3.5+dfsg-1 и другие)

[ Источник: covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Другие пакеты, относящиеся к covtobed

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: zlib1g

  библиотека сжатия

Загрузка covtobed

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1.3.5+dfsg-1+b1	48,8 Кб	143,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.3.5+dfsg-1+b1	42,8 Кб	147,0 Кб	[список файлов]
armel	1.3.5+dfsg-1+b1	41,7 Кб	146,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.3.5+dfsg-1+b1	43,1 Кб	146,0 Кб	[список файлов]
i386	1.3.5+dfsg-1+b1	51,5 Кб	150,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.3.5+dfsg-1+b1	45,5 Кб	217,0 Кб	[список файлов]
mipsel	1.3.5+dfsg-1+b1	45,2 Кб	215,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.3.5+dfsg-1+b1	48,4 Кб	211,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.3.5+dfsg-1+b1	42,4 Кб	143,0 Кб	[список файлов]