Pakiet: covtobed (1.3.5+dfsg-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: covtobed  ]

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Inne pakiety związane z covtobed

• dep: bamtools

  toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie covtobed

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.3.5+dfsg-1+b1	48,8 KiB	143,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.3.5+dfsg-1+b1	42,8 KiB	147,0 KiB	[lista plików]
armel	1.3.5+dfsg-1+b1	41,7 KiB	146,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.3.5+dfsg-1+b1	43,1 KiB	146,0 KiB	[lista plików]
i386	1.3.5+dfsg-1+b1	51,5 KiB	150,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.3.5+dfsg-1+b1	45,5 KiB	217,0 KiB	[lista plików]
mipsel	1.3.5+dfsg-1+b1	45,2 KiB	215,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.3.5+dfsg-1+b1	48,4 KiB	211,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.3.5+dfsg-1+b1	42,4 KiB	143,0 KiB	[lista plików]