Package: covtobed (1.3.5+dfsg-1 and others)

[ Source: covtobed  ]

Konverter coverage-sporet fra en BAM-fil til en BED-fil

Læser en (eller flere) sammenligningsfiler (sorteret BAM) og udskriver en BED med dækningen. Programmet vil forene fortløbende baser med den samme dækning og kan bruges til kun at udskrive en BED-fil med regionerne der har et specifikt dækningsinterval.

Other Packages Related to covtobed

• dep: bamtools

  Værktøjssæt for manipulering af BAM-filer - sammenligning af arvemasser

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  Dynamisk bibliotek til at manipulere BAM-filer (genomsammenligning)

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download covtobed

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.3.5+dfsg-1+b1	48.8 kB	143.0 kB	[list of files]
arm64	1.3.5+dfsg-1+b1	42.8 kB	147.0 kB	[list of files]
armel	1.3.5+dfsg-1+b1	41.7 kB	146.0 kB	[list of files]
armhf	1.3.5+dfsg-1+b1	43.1 kB	146.0 kB	[list of files]
i386	1.3.5+dfsg-1+b1	51.5 kB	150.0 kB	[list of files]
mips64el	1.3.5+dfsg-1+b1	45.5 kB	217.0 kB	[list of files]
mipsel	1.3.5+dfsg-1+b1	45.2 kB	215.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.3.5+dfsg-1+b1	48.4 kB	211.0 kB	[list of files]
s390x	1.3.5+dfsg-1+b1	42.4 kB	143.0 kB	[list of files]