[ Source: gmap ]
Package: gmap (2024-11-20+ds-1)
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- Homepage [research-pub.gene.com]
Similar packages:
allineamento tollerante agli SNP e con splicing per mRNA e letture corte
Questo pacchetto contiene i programmi GMAP e GSNAP, oltre ad utilità per gestire database di genomi in formato GMAP/GSNAP. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) è uno strumento per allineare sequenze di EST, mRNA e cDNA. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) è uno strumento per allineare letture di trascrittoma a terminali singoli e appaiati. Entrambi gli strumenti possono usare un database di:
* siti di splicing noti e identificare nuovi siti di splice; * polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) noti.GSNAP può allineare DNA trattato con bisolfito.
Other Packages Related to gmap
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- dep: libbz2-1.0
- libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: perl
- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- libreria di compressione - runtime
Download gmap
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 33,744.7 kB | 268,822.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 6,859.2 kB | 61,266.0 kB | [list of files] |
| armel | 4,930.9 kB | 46,231.0 kB | [list of files] |
| armhf | 4,950.9 kB | 44,107.0 kB | [list of files] |
| i386 | 5,170.3 kB | 46,587.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 5,924.4 kB | 57,816.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 7,139.9 kB | 63,634.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 6,368.6 kB | 59,310.0 kB | [list of files] |