[ Source: gmap ]
Paketti: gmap (2024-08-20+ds-1)
Links for gmap
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti gmap:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Shaun Jackman (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Alexandre Mestiashvili (Laadunvalvontasivu)
- Étienne Mollier (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [research-pub.gene.com]
Samankaltaisia paketteja:
spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of
* known splice sites and identify novel splice sites. * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).GSNAP can align bisulfite-treated DNA.
Muut pakettiin gmap liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- high-quality block-sorting file compressor library - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: perl
- Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi gmap
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
amd64 | 33,868.9 kt | 268,618.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 6,876.8 kt | 61,194.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 4,856.2 kt | 46,203.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 4,954.0 kt | 44,079.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 5,202.6 kt | 46,551.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 5,881.3 kt | 57,807.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 7,086.6 kt | 63,626.0 kt | [tiedostoluettelo] |
riscv64 | 6,341.5 kt | 59,286.0 kt | [tiedostoluettelo] |