Package: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5 and others)

[ Source: tvc  ]

strumento per identificare varianti per le piattaforme di sequenziamento Ion Torrent

Torrent Variant Caller (TVC) è uno strumento per identificare varianti per le piattaforme di sequenziamento Ion Torrent ed è specialmente ottimizzato per sfruttare le informazioni del flusso di segnali sottostante nel modello statistico per valutare le varianti. Torrent Variant Caller è progettato per identificare polimorfismi a singolo nucleotide (SNP), polimorfismi a nucleotide multiplo (MNP), inserzioni, delezioni e sostituzioni di blocchi.

Other Packages Related to tvc

• dep: libarmadillo14 (>= 1:14.0.1+dfsg)

  libreria snella in C++ per algebra lineare

• dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

  libreria dinamica per manipolare file BAM (allineamento di genoma)

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  libreria per la misura dell'entropia di flussi di byte

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, ppc64el, riscv64]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6)

  libreria per leggere e scrivere JSON per C++

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determina regioni simili tra due stringhe o sequenze genomiche (libreria)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download tvc

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,088.5 kB	3,505.0 kB	[list of files]
arm64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	992.7 kB	3,349.0 kB	[list of files]
armel	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	963.5 kB	3,177.0 kB	[list of files]
armhf	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	977.4 kB	2,697.0 kB	[list of files]
i386	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,117.9 kB	3,544.0 kB	[list of files]
mips64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,003.8 kB	3,751.0 kB	[list of files]
ppc64el	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,067.7 kB	3,732.0 kB	[list of files]
riscv64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,048.0 kB	2,913.0 kB	[list of files]
s390x	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,061.0 kB	3,520.0 kB	[list of files]