Package: flexbar (1:3.5.0-6)
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Similar packages:
Experimental package
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rimozione flessibile di codice a barre e adattatore per piattaforme di sequenziamento
Flexbar pre-elabora in modo efficiente grosse moli di dati di sequenziamento. Fa il demultiplexing di corse con codici a barre e rimuove sequenze adattatore. Inoltre sono fornite funzionalità di taglio e filtraggio. Flexbar aumenta i tassi di mappatura e migliora gli assemblati di genomi e trascrittomi. Gestisce dati di sequenziamento di nuova generazione in formato fasta/q e csfasta/q dalla piattaforma SOLiD, Illumina e Roche 454.
I nomi dei parametri in Flexbar sono cambiati. Rivedere i propri script. Negli ultimi mesi, le impostazioni predefinite sono state ottimizzate, sono stati risolti diversi bug e sono stati fatti vari miglioramenti, ad esempio un'interfaccia a riga di comando rimessa a nuovo, nuove modalità di taglio così come una quantità richiesta minore di tempo e memoria.
Other Packages Related to flexbar
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- dep: libbz2-1.0
- libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime
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- dep: libc6 (>= 2.38) [not sh4]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]
- libreria GNU Standard C++, versione 3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [not m68k]
-
- dep: libtbb12 (>= 2021.12.0) [not amd64, hppa]
- libreria per parallelismo per C++ -- file runtime
- dep: libtbb12 (>= 2021.4.0) [amd64]
- dep: libtbb12 (>= 2021.5.0) [hppa]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
Download flexbar
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 371.3 kB | 1,262.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 320.3 kB | 1,214.0 kB | [list of files] |
| armel | 316.8 kB | 1,157.0 kB | [list of files] |
| armhf | 326.0 kB | 901.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 320.0 kB | 1,114.0 kB | [list of files] |
| i386 | 374.7 kB | 1,257.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 317.5 kB | 1,165.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 301.8 kB | 1,385.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 352.2 kB | 1,534.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 356.7 kB | 1,406.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 354.0 kB | 1,006.0 kB | [list of files] |
| s390x | 360.9 kB | 1,282.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 430.0 kB | 1,214.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 285.4 kB | 2,116.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 369.5 kB | 1,193.0 kB | [list of files] |