Package: flexbar (1:3.5.0-5 and others)
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- Homepage [github.com]
Similar packages:
rimozione flessibile di codice a barre e adattatore per piattaforme di sequenziamento
Flexbar pre-elabora in modo efficiente grosse moli di dati di sequenziamento. Fa il demultiplexing di corse con codici a barre e rimuove sequenze adattatore. Inoltre sono fornite funzionalità di taglio e filtraggio. Flexbar aumenta i tassi di mappatura e migliora gli assemblati di genomi e trascrittomi. Gestisce dati di sequenziamento di nuova generazione in formato fasta/q e csfasta/q dalla piattaforma SOLiD, Illumina e Roche 454.
I nomi dei parametri in Flexbar sono cambiati. Rivedere i propri script. Negli ultimi mesi, le impostazioni predefinite sono state ottimizzate, sono stati risolti diversi bug e sono stati fatti vari miglioramenti, ad esempio un'interfaccia a riga di comando rimessa a nuovo, nuove modalità di taglio così come una quantità richiesta minore di tempo e memoria.
Other Packages Related to flexbar
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- dep: libbz2-1.0
- libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime
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- dep: libc6 (>= 2.34) [not arm64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, riscv64]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
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- dep: libstdc++6 (>= 12) [not arm64, riscv64]
- libreria GNU Standard C++, versione 3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
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- dep: libtbb12 (>= 2021.11.0) [riscv64]
- libreria per parallelismo per C++ -- file runtime
- dep: libtbb12 (>= 2021.12.0) [arm64]
- dep: libtbb12 (>= 2021.4.0) [amd64]
- dep: libtbb12 (>= 2021.8.0) [not amd64, arm64, riscv64]
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
Download flexbar
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1:3.5.0-5 | 347.6 kB | 1,165.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 1:3.5.0-5+b1 | 317.7 kB | 1,214.0 kB | [list of files] |
| armel | 1:3.5.0-5 | 288.9 kB | 1,040.0 kB | [list of files] |
| armhf | 1:3.5.0-5 | 299.0 kB | 820.0 kB | [list of files] |
| i386 | 1:3.5.0-5 | 353.1 kB | 1,184.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 1:3.5.0-5 | 285.8 kB | 1,321.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 1:3.5.0-5 | 336.8 kB | 1,341.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 1:3.5.0-5+b1 | 342.7 kB | 998.0 kB | [list of files] |
| s390x | 1:3.5.0-5 | 302.9 kB | 1,185.0 kB | [list of files] |