Package: flexbar (1:3.5.0-3)
Links for flexbar
Debian Resources:
Download Source Package flexbar:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
rimozione flessibile di codice a barre e adattatore per piattaforme di sequenziamento
Flexbar pre-elabora in modo efficiente grosse moli di dati di sequenziamento. Fa il demultiplexing di corse con codici a barre e rimuove sequenze adattatore. Inoltre sono fornite funzionalità di taglio e filtraggio. Flexbar aumenta i tassi di mappatura e migliora gli assemblati di genomi e trascrittomi. Gestisce dati di sequenziamento di nuova generazione in formato fasta/q e csfasta/q dalla piattaforma SOLiD, Illumina e Roche 454.
I nomi dei parametri in Flexbar sono cambiati. Rivedere i propri script. Negli ultimi mesi, le impostazioni predefinite sono state ottimizzate, sono stati risolti diversi bug e sono stati fatti vari miglioramenti, ad esempio un'interfaccia a riga di comando rimessa a nuovo, nuove modalità di taglio così come una quantità richiesta minore di tempo e memoria.
Other Packages Related to flexbar
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.30) [armel]
- dep: libc6 (>= 2.7) [not amd64, arm64, armel, ppc64el]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libstdc++6 (>= 10.2) [armel]
- libreria GNU Standard C++, versione 3
- dep: libstdc++6 (>= 7) [armhf]
- dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]
-
- dep: libtbb2 (>= 2017~U7) [amd64]
- libreria per parallelismo per C++ -- file runtime
- dep: libtbb2 (>= 2020.3) [not amd64]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
Download flexbar
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
amd64 | 343.4 kB | 1,154.0 kB | [list of files] |
arm64 | 296.7 kB | 1,090.0 kB | [list of files] |
armel | 285.4 kB | 1,025.0 kB | [list of files] |
armhf | 298.0 kB | 809.0 kB | [list of files] |
i386 | 348.4 kB | 1,165.0 kB | [list of files] |
mips64el | 283.8 kB | 1,289.0 kB | [list of files] |
mipsel | 285.8 kB | 1,258.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 331.8 kB | 1,342.0 kB | [list of files] |
s390x | 298.1 kB | 1,158.0 kB | [list of files] |