Package: murasaki (1.68.6-13 and others)

[ Source: murasaki  ]

strumento per rilevazione di omologie tra più genomi vasti

Murasaki è uno strumento per la rilevazione di omologie in più genomi vasti veloce e basato sulla teoria del linguaggio. Permette allineamenti globali multipli di genomi su scala di intero genoma. Gestisce modelli di lunghezza illimitata con gap e seed e filtraggio unico basato su TF-IDF.

Murasaki è un software per allineamento ad ancore, che è

 * estremamente veloce (17 ore di CPU per l'intero genoma uomo x topo (con
   40 nodi: 52 minuti di orologio))
 * scalabile (parallelizzabile a piacimento tra più nodi usando MPI. Anche
   un singolo nodo con 16 GB di RAM può gestire più di 1 Gpb di sequenza.)
 * con lunghezza illimitata dei modelli
 * tollerante alle ripetizioni
 * con riduzione intelligente del rumore

Other Packages Related to murasaki

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  operazioni su filesystem (percorsi portabili, iterazione su directory, ecc.) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  libreria Boost.Iostreams

• dep: libboost-regex1.74.0-icu72

  virtual package provided by libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: murasaki-common

  strumento per rilevazione di omologie tra più genomi vasti (file comuni)

Download murasaki

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.68.6-13+b3	506.7 kB	3,163.0 kB	[list of files]
arm64	1.68.6-13+b3	444.2 kB	3,339.0 kB	[list of files]
armel	1.68.6-13+b3	370.9 kB	2,813.0 kB	[list of files]
armhf	1.68.6-13+b3	378.1 kB	2,045.0 kB	[list of files]
i386	1.68.6-13+b3	518.1 kB	3,013.0 kB	[list of files]
mips64el	1.68.6-13+b3	480.3 kB	4,390.0 kB	[list of files]
mipsel	1.68.6-13+b3	471.9 kB	3,959.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.68.6-13+b2	503.7 kB	4,171.0 kB	[list of files]
s390x	1.68.6-13+b2	450.2 kB	3,351.0 kB	[list of files]