Пакет: murasaki (1.68.6-13 и другие)

[ Источник: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Другие пакеты, относящиеся к murasaki

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  библиотека Boost.Iostreams

• dep: libboost-regex1.74.0-icu72

  виртуальный пакет, предоставляемый libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, i386, mipsel]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Загрузка murasaki

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1.68.6-13+b3	506,7 Кб	3 163,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.68.6-13+b3	444,2 Кб	3 339,0 Кб	[список файлов]
armel	1.68.6-13+b3	370,9 Кб	2 813,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.68.6-13+b3	378,1 Кб	2 045,0 Кб	[список файлов]
i386	1.68.6-13+b3	518,1 Кб	3 013,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.68.6-13+b3	480,3 Кб	4 390,0 Кб	[список файлов]
mipsel	1.68.6-13+b3	471,9 Кб	3 959,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.68.6-13+b2	503,7 Кб	4 171,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.68.6-13+b2	450,2 Кб	3 351,0 Кб	[список файлов]