Paketti: murasaki (1.68.6-13 ja muut)

[ Source: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Muut pakettiin murasaki liittyvät paketit

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Boost.Iostreams -kirjasto

• dep: libboost-regex1.74.0-icu72

  näennäispaketti, jonka toteuttaa libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, i386, mipsel]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Imuroi murasaki

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1.68.6-13+b3	506.7 kt	3,163.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.68.6-13+b3	444.2 kt	3,339.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.68.6-13+b3	370.9 kt	2,813.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.68.6-13+b3	378.1 kt	2,045.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.68.6-13+b3	518.1 kt	3,013.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.68.6-13+b3	480.3 kt	4,390.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	1.68.6-13+b3	471.9 kt	3,959.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.68.6-13+b2	503.7 kt	4,171.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.68.6-13+b2	450.2 kt	3,351.0 kt	[tiedostoluettelo]