[ Source: murasaki ]
Paketti: murasaki (1.68.6-13 ja muut)
Links for murasaki
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti murasaki:
- [murasaki_1.68.6-13.dsc]
- [murasaki_1.68.6.orig-debian-tests-data.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6.orig.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6-13.debian.tar.xz]
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Nilesh Patra (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
Samankaltaisia paketteja:
homology detection tool across multiple large genomes
Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.
Murasaki is an anchor alignment software, which is
* exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with 40 nodes: 52 wall minutes)) * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI. Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.) * unlimited pattern length * repeat tolerant * intelligent noise reduction
Muut pakettiin murasaki liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)
- filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
-
- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)
- Boost.Iostreams -kirjasto
-
- dep: libboost-regex1.74.0-icu72
- näennäispaketti, jonka toteuttaa libboost-regex1.74.0
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, i386, mipsel]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: murasaki-common
- homology detection tool across multiple large genomes (common files)
Imuroi murasaki
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
amd64 | 1.68.6-13+b3 | 506.7 kt | 3,163.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 1.68.6-13+b3 | 444.2 kt | 3,339.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 1.68.6-13+b3 | 370.9 kt | 2,813.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 1.68.6-13+b3 | 378.1 kt | 2,045.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 1.68.6-13+b3 | 518.1 kt | 3,013.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 1.68.6-13+b3 | 480.3 kt | 4,390.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mipsel | 1.68.6-13+b3 | 471.9 kt | 3,959.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 1.68.6-13+b2 | 503.7 kt | 4,171.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 1.68.6-13+b2 | 450.2 kt | 3,351.0 kt | [tiedostoluettelo] |