Package: murasaki (1.68.6-12)

[ Source: murasaki  ]

strumento per rilevazione di omologie tra più genomi vasti

Murasaki è uno strumento per la rilevazione di omologie in più genomi vasti veloce e basato sulla teoria del linguaggio. Permette allineamenti globali multipli di genomi su scala di intero genoma. Gestisce modelli di lunghezza illimitata con gap e seed e filtraggio unico basato su TF-IDF.

Murasaki è un software per allineamento ad ancore, che è

 * estremamente veloce (17 ore di CPU per l'intero genoma uomo x topo (con
   40 nodi: 52 minuti di orologio))
 * scalabile (parallelizzabile a piacimento tra più nodi usando MPI. Anche
   un singolo nodo con 16 GB di RAM può gestire più di 1 Gpb di sequenza.)
 * con lunghezza illimitata dei modelli
 * tollerante alle ripetizioni
 * con riduzione intelligente del rumore

Other Packages Related to murasaki

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  operazioni su filesystem (percorsi portabili, iterazione su directory, ecc.) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  libreria Boost.Iostreams

• dep: libboost-regex1.74.0-icu67

  virtual package provided by libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: murasaki-common

  strumento per rilevazione di omologie tra più genomi vasti (file comuni)

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	509.4 kB	3,247.0 kB	[list of files]
arm64	445.1 kB	2,871.0 kB	[list of files]
armel	369.5 kB	2,377.0 kB	[list of files]
armhf	378.9 kB	1,689.0 kB	[list of files]
i386	526.6 kB	3,105.0 kB	[list of files]
mips64el	481.2 kB	3,955.0 kB	[list of files]
mipsel	474.4 kB	3,599.0 kB	[list of files]
ppc64el	504.5 kB	4,235.0 kB	[list of files]
s390x	451.1 kB	3,355.0 kB	[list of files]