Paquet : murasaki (1.68.6-13 et autres)

[ Paquet source : murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Autres paquets associés à murasaki

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  opérations sur le système de fichiers (chemins portables, itération sur des répertoires,⋅etc.) en C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  bibliothèque Boost.Iostreams

• dep: libboost-regex1.74.0-icu72

  paquet virtuel fourni par libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, i386, mipsel]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Télécharger murasaki

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.68.6-13+b3	506,7 ko	3 163,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.68.6-13+b3	444,2 ko	3 339,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.68.6-13+b3	370,9 ko	2 813,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.68.6-13+b3	378,1 ko	2 045,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.68.6-13+b3	518,1 ko	3 013,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.68.6-13+b3	480,3 ko	4 390,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	1.68.6-13+b3	471,9 ko	3 959,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.68.6-13+b2	503,7 ko	4 171,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.68.6-13+b2	450,2 ko	3 351,0 ko	[liste des fichiers]