Paquet : tantan (51-1)

[ Paquet source : tantan  ]

masqueur de répétitions en tandem peu complexes pour bioséquences

Tantan est un outil pour masquer des régions simples (peu complexes et avec peu de répétitions en tandem sur une période courte) dans des séquences d'ADN, d'ARN et de protéines. Le but de tantan est d'empêcher les prédictions fausses lorsqu'on cherche des régions homologues entre deux séquences. Les répétitions simples s'alignent souvent fortement, créant de fausses prévisions d'homologie.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c++, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: scope::utility, works-with::biological-sequence

Autres paquets associés à tantan

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, riscv64]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [non armel, armhf]

  Bibliothèque de compression - binaires

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

Télécharger tantan

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	41,3 ko	120,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	37,7 ko	144,0 ko	[liste des fichiers]
armel	36,9 ko	107,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	34,9 ko	79,0 ko	[liste des fichiers]
i386	44,5 ko	119,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	41,2 ko	149,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	43,9 ko	144,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	40,1 ko	92,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	44,5 ko	124,0 ko	[liste des fichiers]