Paquet : libhts3t64 (1.20+ds-1 et autres)

[ Paquet source : htslib  ]

C library for high-throughput sequencing data formats

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

Autres paquets associés à libhts3t64

• dep: libbz2-1.0

  Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0) [alpha, ia64, x32]

  bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.18.0) [non alpha, ia64, x32]

  bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  compression et décompression de tampon complet rapide basée sur DEFLATE

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  librairie de compression au format XZ

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

  trousse à outils SSL - bibliothèques partagées

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger libhts3t64

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.20+ds-1	438,6 ko	1 406,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.20+ds-1	441,3 ko	1 088,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.20+ds-1	406,3 ko	1 272,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.20+ds-1	384,6 ko	979,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.20+ds-1	389,5 ko	739,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.20+ds-1	451,5 ko	1 189,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.20+ds-1	483,6 ko	1 203,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.19+ds-1.1+b1	550,8 ko	2 073,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.20+ds-1	393,8 ko	979,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.20+ds-1	396,2 ko	1 382,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.20+ds-1	466,3 ko	1 591,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.20+ds-1	478,9 ko	1 527,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.20+ds-1	452,5 ko	924,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.20+ds-1	443,1 ko	1 167,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.20+ds-1	493,3 ko	1 142,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.20+ds-1	385,0 ko	5 264,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.20+ds-1	442,2 ko	1 051,0 ko	[liste des fichiers]