Paquet : bcftools (1.21-1)

[ Paquet source : bcftools  ]

appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF

BCFtools est un ensemble d'outils qui manipulent des appels de variation dans le format « Variant Call Format » (VCF) et son équivalent binaire BCF. Toutes les commandes fonctionnent de façon transparente avec VCF et BCF, qu'ils soient compressés avec BGZF ou non.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Rôle: Programme

Autres paquets associés à bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: sse2-support [i386]

  CPU feature checking - require SSE2

• rec: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• rec: python3-gffutils

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• rec: python3-matplotlib

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab

• sug: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• sug: python3-numpy

  bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live : paquets recommandés pour LaTeX

Télécharger bcftools

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	765,3 ko	2 716,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	689,7 ko	4 156,0 ko	[liste des fichiers]
armel	671,3 ko	4 044,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	673,1 ko	3 724,0 ko	[liste des fichiers]
i386	809,6 ko	2 812,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	702,5 ko	4 357,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	799,1 ko	4 596,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	753,1 ko	2 210,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	785,2 ko	2 765,0 ko	[liste des fichiers]